为落实吉林省《“氢动吉林”中长期发展规划(2021-2035年)》、《“氢动吉林”行动实施方案》，2022年9月，省委、省政府启动了“吉林省氢能产业综合研究院”（以下简称“氢能院”）建设事宜。2023年6月，省政府常务会议审议通过了《吉林省氢能产业综合研究院建设方案》，明确物理空间建设方面由省市区三方出资新建“氢能大厦”，交由氢能院无偿使用。2023年11月，氢能院在应化所总部正式揭牌。2024年7月，根据省政府最新文件精神，由新建“氢能大厦”，调整为改造新区长春智能光谷产业园。2025年11月11日，氢能院位于长智光谷的新址正式投入运营。

氢能院是由省政府批准设立，依托长春应化所作为内设机构进行管理的非独立法人机构，首任院长为应化所刘俊所长（2023年底挂牌时任应化所副所长），现任院长为应化所张新波副所长。氢能院位于长智光谷西地块3号楼、4号楼，建筑面积20549.58平方米。

氢能院以“强氢技术、育氢产业”为使命，聚焦国际氢能产业发展趋势和国家“碳达峰﹒碳中和”目标，定位于氢能技术开发和产业链延伸，致力于打造氢能产业重大创新技术策源地、氢能科技成果转化与高新技术企业孵化平台、氢能产业公共服务平台和氢能人才培养引进平台。氢能院将孵化一批氢能创新型企业，推动一批氢能重大产业落地吉林，为吉林省氢能相关企业提供高水平的科技创新服务，为吉林省擘画“一区、两轴、四基地”氢能产业布局提供强有力的科技引领和支撑。